Max & the Magic Marker wird Fans von Plattformspielen bekannt sein, bietet aber eine einzigartige Wendung, die die Vorstellungskraft des Spielers buchstäblich freien Lauf lässt. Der Spieler muss den Zauberstift benutzen, um Rätsel zu lösen, Hindernisse zu überwinden und Feinde zu besiegen. Unterwegs muss man Tinte sammeln, um weiterzeichnen zu können. Auf der Wii steuert der Spieler die Bewegung mit dem Nunchuk, während die Fernbedienung den Marker steuert. Der Spieler kann jederzeit die Aktion pausieren, um sich aus kniffligen Situationen herauszuzeichnen. Max, der Held des Spiels, ist ein kleiner Junge, der gerne zeichnet. Eines Tages erhält er einen mysteriösen orangefarbenen Marker mit der Post. Als er anfängt, mit dem mysteriösen Marker zu zeichnen, bemerkt er schnell, dass er magische Kräfte hat. Alles, was Max zeichnet, beginnt sich auf dem Papier zu bewegen und wird lebendig. Das Monster, das er zeichnet, beginnt, mit Max' Kunstwerken herumzualbern, und so beschließt Max, sich selbst in sein Bild zu zeichnen, und dort beginnt das Abenteuer.